Phường Lê Thanh Nghị được thành lập vào ngày 28 tháng 10 năm 1996 trên cơ sở điều chỉnh 140 ha diện tích tự nhiên và 8.100 người của phường Trần Phú.[1]

Ngày 23 tháng 9 năm 2009, Chính phủ ban hành Nghị quyết số 47/NQ-CP[4]. Theo đó, điều chỉnh 15,65 ha diện tích tự nhiên và 884 người của phường Thanh Bình về phường Lê Thanh Nghị quản lý.

Sau khi điều chỉnh địa giới hành chính, phường Lê Thanh Nghị có 99,59 ha diện tích tự nhiên và 9.207 người.

Ngày 16 tháng 10 năm 2019, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết số 788/NQ-UBTVQH14 về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp huyện, cấp xã thuộc tỉnh Hải Dương (nghị quyết có hiệu lực từ ngày 1 tháng 12 năm 2019)[3][5]. Theo đó:

• Điều chỉnh 26,19 ha diện tích tự nhiên và 267 người của phường Hải Tân; 4,16 ha diện tích tự nhiên và 4 người của phường Trần Phú về phường Lê Thanh Nghị
• Điều chỉnh 4,65 ha diện tích tự nhiên và 42 người của phường Lê Thanh Nghị về phường Trần Phú.

Sau khi điều chỉnh địa giới hành chính, phường Lê Thanh Nghị có 128,48 ha diện tích tự nhiên và 14.805 người.